2009 m. įsteigtos 8 seniūnaitijos:

  Kęstučio seniūnaitija: 
Skuodo, Bobiliškių, Sodų, Kęstučio, Kaštonų, Akmenų, Rožių, Gėlių gatvės Mosėdžio miest.

 Krakių seniūnaitija: 
Krakių, Tėvelių, Būdvietės, Virbalų, Nevočių kaimai.

Liepų seniūnaitija: 
M. Kalniškių, Palaukės, Gandlaukės, Šerkšnių kaimai; Gluosnių, Sportininkų, Šačių, Liepų, Šilų gatvės Mosėdžio miest.

Muziejaus seniūnaitija: 
Muziejaus, Salantų gatvės Mosėdžio miest.; Igarių, Baksčių, Mikulčių, Šilalės, Naujukų kaimai.

Šatraminių seniūnaitija: 
Šatraminių, Palšių kaimai.

  Šauklių seniūnaitija: 
Šauklių, Paeiškūnės, Šaučikių, Šniukščių kaimai.

Šilalės seniūnaitija: 
Naujoji, Ažuolų, Ežero, Pievų, Šilalės, Žalioji gatvės Mosėdžio miest.

Udralių seniūnaitija: 
Udralių, Plaušinių, Tauzų, Gaubių, Bobiliškių, Kusų kaimai.